Identification de bioindicateurs d'impact fluviatile via l'ADNe

Ce projet de recherche se concentre sur l'identification de bioindicateurs microbiens d’impact fluviatile permettant la caractérisation des masses d’eau du large. Les estuaires sont des zones écologiques sensibles, où l'interaction entre l'eau douce des rivières et l'eau salée crée un environnement unique. Les débits fluviatiles jouent un rôle crucial dans la dynamique de ces écosystèmes, influençant la distribution des nutriments, la turbidité et la composition des communautés microbiennes. L'objectif principal est d'utiliser l'ADN environnemental afin de détecter et d'identifier des communautés spécifiques de bactéries et de protistes qui proviennent des eaux douces en amont des estuaires et qui pourraient être utilisées comme indicateurs fiables de l'influence des flux fluviaux sur les milieux marins. Pour ce faire, les données du projet ROME (https://rome.ifremer.fr) seront utilisées, permettant de comparer quatre systèmes estuariens différents (notamment de par leurs débits), pour lesquels des prélèvements sont réalisés en zone côtière et au large. En identifiant des marqueurs microbiens spécifiques liés aux apports fluviaux, ces recherches pourraient améliorer notre compréhension du continuum terre-mer et contribuer au développement de stratégies de gestion plus efficaces pour les zones côtières et estuariennes, particulièrement face aux changements climatiques et aux pressions anthropiques croissantes. Post-doctorat financé dans le cadre du projet Horizon Europe OBAMA-NEXT (https://obama-next.eu)