Séminaire d'Arthur Monjot, postdoc à PELAGOS

Bonjour à toutes et à tous,

Le prochain séminaire DYNECO sera présenté par Arthur Monjot, postdoc à Pelagos :

Jeudi 05 décembre 2024 à 11h en salle de réunion DYNECO (Ifremer Plouzané, bâtiment 216)

"Dis-moi qui tu es, je te dirai ce que tu fais : cas des eucaryotes unicellulaires en milieux lacustre"

Résumé:

Au cours des dernières décennies, notre compréhension de la diversité microbienne dans l’environnement a beaucoup progressé notamment avec l’avènement des méthodes de séquençage de nouvelle génération et les approches « -omics ». Leur application a notamment permis de s’affranchir des approches de mise en culture ne contribuant qu’à une évaluation partielle et orientée de la diversité microbienne. En permettant une description exhaustive des espèces présentes dans un écosystème, ces nouvelles méthodes ont révélé une diversité considérable et insoupçonnée d’eucaryotes unicellulaires. Elles sont toutefois essentiellement descriptives et ne permettent en aucun cas de déterminer la physiologie ni de comprendre le rôle de ces microorganismes dans les écosystèmes. Enfin, ces approches de séquençage haut débit conduisent à la production d’une quantité colossale de séquences environnementales dont la majeure partie reste inconnue.

C’est dans ce contexte que j’ai initié mes travaux de thèse qui avaient pour objectif d’étudier le lien diversité-fonction des eucaryotes unicellulaires et ainsi de mieux comprendre leur rôle dans les réseaux trophiques lacustres. Lors de ce séminaire, vous entendrez donc parler de métabarcoding, d’étude de traits morpho-physio-phénotypiques, de métatranscriptomique, de réseaux de similarité de séquences protéiques, mais également d’isolement et caractérisation de couples hôte-parasites (séquençage et hybridation in situ). J’aborderai également les recherches que j’ai menées lors de mon précédent post-doctorat (suivi des communautés microbiennes lacustres par des approches de séquençage long-reads et de paléogénomique) et enfin plus rapidement le projet sur lequel je travaille aujourd’hui au sein de l’unité DYNECO.

Venez nombreux!!!